Indikacije in kontraindikacije za različne fizioterapevtske metode in tehnike večinoma veljajo tako za ljudi, kot tudi za živali. Sama izvedba pregleda in terapije pa je seveda v veterini specifična, saj nam živali ne znajo natančno povedati, kje in kako jih boli ter kako se v resnici počutijo. Poleg tega je včasih za nekatere vrste terapije potrebno pobriti dlako. Protokoli fizioterapije so podobni tistim, ki se uporabljajo v fizioterapiji ljudi, vendar prilagojeni živalskim pacientom.
